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Abe Takashi
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키워드벌크 러닝 자체 조직 맵, 연속 기본 구성, 미생물 생태학, 메타 안전 바카라, 생물학적 시스템 추정

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게놈 디코딩 기술의 극적인 발전으로 게놈 서열 데이터가 기하 급수적으로 증가하고있다 이 중 미생물 게놈은 가장 많은 용량을 차지합니다 그것은 풍부한 새로운 유전자를 가지고 다니는 것으로 생각되며 산업적으로나 의학적으로 주목을 받고 있습니다 그러나 자연 환경에 사는 미생물의 99% 이상은 문화가 어렵고 정상적인 실험 안전 바카라에서 수행 할 수 없으며, 높은 참신함 때문에 서열 상 동성 검색과 같은 기존의 정보 적 방법을 사용하더라도 생물학적 시스템 및 유전자 기능을 추정하는 것은 거의 불가능합니다 
우리는 감독되지 않은 기계 학습 시스템 인 BLSOM (Batch-Learning Self-Organizing Map)을 개발하여 변수로서 연속 기본 발생의 빈도를 사용하여 ATGC에서 4 개의 염기로 구성된 간단한 문자열로서 Genomes 자체의 초대형 게놈 서열에서 종의 독특한 시퀀스 기능을 파악할 수 있습니다 이 방법을 사용하면 대량의 게놈 정보의 특성을 포괄적이고 조감도 시각화 할 수 있으므로 시각적으로 쉽게 이해할 수 있습니다 또한, 우리는 메타 게놈 분석에서 파생 된 각 서열의 생물학적 시스템과 참신함을 추정하는 방법을 개발했으며, 더 많은 안전 바카라자들이 사용할 수있는 소프트웨어를 발표했습니다
우리는 세계에서 처음으로 안전 바카라 된 기술을 사용하여 새로운 미생물과 의학 및 산업 사용에 유용한 유용한 유전자를 탐색하기위한 기본 정보를 구축하고 제공하는 것을 목표로합니다

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BLSOM 알고리즘 (상단) 및 BLSOM 분석 결과의 예 (아래)
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Metagenomic 서열에 대한 PEMS 계통 발생 학적 추정 소프트웨어 요약

관련 지적 재산
기사 등

올리고 뉴클레오티드 발생 빈도를위한 물질 분류 시안전 바카라 및 분석 시안전 바카라 (일본어 비방 된 특허 출판 번호 2005-092786)
Abe et al, 미안전 바카라학의 프론티어, 11 : 1486, 2020
Okunaga et al, NPJ Clean Water, 5 : 65, 2022

항소 지점

기계 안전 바카라을 사용한 분석 결과의 매우 정확한 클러스터링 및 조감도 시각화
안전 바카라 분석은 바이러스, 박테리아, 원생 동물 및 식물을 포함한 광범위한 종에 대한 입증 된 실적을 가지고 있습니다

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